チョコレートと呼ばれるバリアントは、犬の被毛において濃い茶色またはチョコレート色の発色として現れます。この遺伝的バリアントをTYRP1遺伝子に持つ犬は、鼻、足の裏の肉球、爪、および目の縁にも茶色の色素沈着を示します。さらに、目の色は通常、黒色の犬と比較して明るくなります（黄色、蜂蜜色、琥珀色など）。この表現型は、ユーメラニン（黒色色素）の生合成とメラノソームの維持に重要な役割を果たすTYRP1遺伝子（別名B座）の変異の結果です。チョコレート色の被毛は、TYRP1遺伝子の機能喪失変異によって生じ、ユーメラニンの正常な生成を妨げ、黒色色素の代わりに茶色またはチョコレート色の色素が形成されます。
TYRP1遺伝子の正常な機能に影響を与える少なくとも6つの異なる遺伝子変異が確認されています。本研究では、最もよく知られている3つの変異体、すなわち、アレロbc（c.121T>A）、アレロbs（c.991C>T）、およびアレロbd（c.1033_1035del）を分析しました。チョコレート色の毛皮の特性は、常染色体劣性遺伝のパターンに従います。これは、犬が黒色の代わりにチョコレート色の茶色の色素を生成するためには、これら3つの変異体のうちの1つのコピーが2つ必要であることを意味します。さらに、犬が2つの異なる変異体のコピーを1つずつ持っている場合、チョコレート色が発現する可能性があります。これは、複合ヘテロ接合として知られる現象です。アレルbc、bs、またはbdのコピーを1つだけ持っている場合、チョコレート色の毛皮にはなりませんが、50％の確率で子孫に伝わる可能性があります。ただし、これらの変異体のいずれかが、本研究で分析されていない別の変異体と組み合わされた場合、チョコレート色の表現型が発現する可能性があります。
この特徴は、レバー色、茶色、栗色など、他の名前でも知られています。チョコレート色の濃さは、濃くて深いチョコレート色から、より明るい茶色まで様々です。オーストラリアン・シェパード、ジャーマン・シェパード、ランカシャー・ヒーラー、レオンベルガー、アメリカン・ミニチュア・シェパード、シベリアン・ハスキーなどの犬種は、この特徴をより頻繁に持つ傾向があります。興味深いことに、ビズラ犬種では、TYRP1遺伝子の変異の有無にかかわらず、ほとんどの犬が茶色の鼻を持っています。
